土壌細菌群集とは、土壌中に生息する多種多様な細菌の集合体のこと。
これらの細菌は、有機物の分解や窒素固定、病原菌の抑制などを通じて、土壌の健康と生態系の維持に重要な役割を果たす。その構成は、土壌の種類、気候、植生、農業管理などの要因によって異なり、非常に高い多様性を持つ。
また、土壌細菌群集は、呼吸による二酸化炭素放出や、窒素循環の一環としての亜酸化窒素の生産やメタン収支への影響を通して、土壌と大気の間の温室効果ガスの収支に大きな影響を与えている。